電熱水器尤其是儲水式電熱水器極易產生水垢，常見的水垢組成成分為：碳酸鈣、硫酸鈣、硅酸鈣等。水垢是當含有鈣、鎂等鹽類雜質的水進入加熱體后，吸收高溫傳給的熱量，鈣、鎂鹽類雜質發生化學反應，生成難溶物質析出。當達到一定濃度時，析出物就會成為固體沉淀，在受熱面的內壁上形成。水垢產生后，如果不及時清潔，將會給水質和產品使用帶來危害。
水垢的導熱系數比金屬低得多，集熱管結有水垢會嚴重影響水加熱，堅硬的水垢能使電熱能轉換率降低甚至失效。而且水垢會占據一定的儲水空間，造成儲水量減少。家用儲水式電熱水器一般利用鎂棒釋放鎂離子來減緩水堿、水垢對內膽的腐蝕。但使用時間久了的熱水器，鎂棒就會消耗得面目全非，如果不及時更換，熱水器的內壁就會被腐蝕，容易漏水漏電。電熱水器用一段時間后，如果感覺加熱慢、耗電量大，就有可能是鎂棒該更換了。
很多人可能覺著家里使用了好多年從來沒清洗過的熱水器出的水依然很清澈，就覺著里面不存在水垢等，事實上，在平時用熱水器的時候，冷水管是一直進水的，熱水被冷水擠壓到頂部，順著熱水管出水，而水垢則沉淀在內膽底部，并不會通過熱水管排出來。熱水器每隔3年，就要深度清洗一次，深度清洗需要打開熱水器維修孔，因此，為保證安全，最好請專業的維修工清潔。
在日常的使用過程中，采取一些小方法能夠有效地減少水垢的產生。由于普通電熱水器的發熱管通常置于水中將水加熱，水質的好壞直接影響發熱管表面水垢的形成速度及腐蝕程度。可在電熱水器冷水進口處加裝凈化水裝置，過濾掉有害的雜質及礦物質，達到減少水垢的目的。水垢的生成速度與水溫和水的流動情況有關。水在高溫和靜止的情況下容易產生水垢，故在使用中要盡量避免上述兩種情況。不要把水溫調得太高，在使用電熱水器的時候，將使用溫度調到50～60℃之間為宜。電熱水器使用完畢，在關掉電源后，再開啟自來水閥，讓冷水通過循環水管10秒鐘左右，使熱交換水管內的熱水和水汽排出來，這樣循環水管內就不會結水垢，又能使元部件及時冷卻，延長使用壽命。
